本校は明治６年に行合小学校、金屋小学校、小川小学校として開校し、明治２３年に高瀬尋常小学校と改称。小川、下行合分教室を設置した。
大正１５年２月に現在の上行合艮耕地に統合移転が認可され、１２月１７日上棟式、昭和２年５月に落成式を挙行。１２月に高等科を設置した。名称も高瀬国民学校と改称し、校歌を制定した。
昭和２２年に新学制発足により高瀬小学校と改称し中学校を併設した。中学校は翌２３年校舎が落成し分離移転した。昭和３０年田村町立高瀬小学校と改称。昭和４０年郡山市に合併、市立高瀬小学校となり現在に至っている。新学制発足以来の卒業生は、平成１6年度末で４719人である。
【昭和４０年からの主な沿革】
昭和４２年 ５月 校舎建築４０周年式典挙行
昭和４３年１１月 子ども銀行中央表彰
昭和４５年 ３月 校舎改築第一期工事完了
昭和４７年 ４月 金屋一部永盛小学校学区となる。
子ども銀行文部大臣、日銀総裁より表彰
昭和４９年 ４月 校舎改築第二期工事完了
昭和５１年１２月 屋内体育館落成
昭和５３年 ６月 プール竣工式
昭和５３年１１月 高瀬教育百周年式典挙行
昭和５５年 ３月 校歌碑建立（昭和５４年度卒業記念）
昭和５６年 ２月 校舎増築落成記念式典
昭和５６年１０月 県下小中学校合奏コンクール銀賞受賞
昭和５７年 ６月 市内小学校陸上交歓会リレー優勝
昭和５９年１０月 市研究推進校指定 学校体育学習指導法研究発表会
昭和６２年１１月 第３９回郡山菊花大会知事賞受賞
昭和６３年 ４月 体育館東わきに通路新設
平成 元年 ２月 校舎前通路新設
平成 ４年 ４月 飼育小屋完成
平成 ５年 １月 小学校教育研究会創立３０周年記念論文優秀賞受賞
平成 ６年１１月 国際理解教育文部大臣賞受賞
平成 ８年 ８月 パーソナルコンピュータ専用教室改造設置
平成 ９年１１月 子ども１１０当番（緊急避難）の家設置
平成１０年１１月 高瀬教育１２０周年記念式典挙行
平成１２年１０月 防災無線受信装置塔設置
平成１３年１０月 郡山市行政ネットワーク、インターネット、校内ラン設置
平成１４年 １月 非常警報装置設置
平成１４年 ４月 本校ホームページ公開
平成１５年 ６月〜 校舎大規模改修工事始まる
平成１５年１２月 第１期改修工事完了。新校舎での生活が始まる。
平成１６年 ４月 防犯教室の実施
平成１７年 ３月 第２期改修工事完了。全面的に新校舎での生活が始まる。
平成１７年 ４月 学校図書館データベース化
平成１９年 ３月 平成１９・２０年度福島県教育委員会
「夢をはぐくむいのち生き生きプロジェクト事業」推進協力校指定
平成１９年１１月 福島県学校保健優良校賞受賞
平成２０年 ３月 プール改修工事